SECOMANDI, SIMONA
SECOMANDI, SIMONA
A chromosome-level reference genome and pangenome for barn swallow population genomics
2023 S. Secomandi, G.R. Gallo, M. Sozzoni, A. Iannucci, E. Galati, L. Abueg, J. Balacco, M. Caprioli, W. Chow, C. Ciofi, J. Collins, O. Fedrigo, L. Ferretti, A. Fungtammasan, B. Haase, K. Howe, W. Kwak, G. Lombardo, P. Masterson, G. Messina, A.P. Møller, J. Mountcastle, T.A. Mousseau, J. Ferrer Obiol, A. Olivieri, A. Rhie, D. Rubolini, M. Saclier, R. Stanyon, D. Stucki, F. Thibaud-Nissen, J. Torrance, A. Torroni, K. Weber, R. Ambrosini, A. Bonisoli-Alquati, E.D. Jarvis, L. Gianfranceschi, G. Formenti
How genomics can help biodiversity conservation
2023 K. Theissinger, C. Fernandes, G.P. Formenti, I. Bista, P. R Berg, C. Bleidorn, A. BOMBARELY GOMEZ, A. Crottini, G. R Gallo, J. A Godoy, S. Jentoft, J. Malukiewicz, A. Mouton, R. A Oomen, S. Paez, P. J Palsbøll, C. Pampoulie, M. J Ruiz-López, S. Secomandi, H. Svardal, C. Theofanopoulou, J. de Vries, A. Waldvogel, G. Zhang, E. D Jarvis, M. Bálint, C. Ciofi, R. M Waterhouse, C. J Mazzoni, J. Höglund, S. A Aghayan, T. S Alioto, I. Almudi, N. Alvarez, P. C Alves, I. R Amorim do Rosario, A. Antunes, P. Arribas, P. Baldrian, G. Bertorelle, A. Böhne, A. BONISOLI ALQUATI, L. L Boštjančić, B. Boussau, C. M Breton, E. Buzan, P. F Campos, C. Carreras, L.F. C Castro, L. J Chueca, F. Čiampor, E. Conti, R. Cook-Deegan, D. Croll, M. V Cunha, F. Delsuc, A. B Dennis, D. Dimitrov, R. Faria, A. Favre, O. D Fedrigo, R. Fernández, G.F. Ficetola, J. Flot, T. Gabaldón, D. R Agius, A. M Giani, M.T. P Gilbert, T. Grebenc, K. Guschanski, R. Guyot, B. Hausdorf, O. Hawlitschek, P. D Heintzman, B. Heinze, M. Hiller, M. Husemann, A. Iannucci, I. Irisarri, K. S Jakobsen, P. Klinga, A. Kloch, C. F Kratochwil, H. Kusche, K. KS Layton, J. A Leonard, E. Lerat, G. Liti, T. Manousaki, T. Marques-Bonet, P. Matos-Maraví, M. Matschiner, F. Maumus, A. M Mc Cartney, S. Meiri, J. Melo-Ferreira, X. Mengual, M. T Monaghan, M. Montagna, R. W Mysłajek, M. T Neiber, V. Nicolas, M. Novo, P. Ozretić, F. Palero, L. Pârvulescu, M. Pascual, O. S Paulo, M. Pavlek, C. Pegueroles, L. Pellissier, G. Pesole, C. R Primmer, A. Riesgo, L. Rüber, D. Rubolini, D. Salvi, O. Seehausen, M. Seidel, B. Studer, S. Theodoridis, M. Thines, L. Urban, A. Vasemägi, A. Vella, N. Vella, S. C Vernes, C. Vernesi, D. R Vieites, C. W Wheat, G. Wörheide, Y. Wurm, G. Zammit
The mitogenome relationships and phylogeography of barn swallows (Hirundo rustica)
2022 G. Lombardo, N. Rambaldi Migliore, G. Colombo, M.R. Capodiferro, G. Formenti, M. Caprioli, E. Moroni, L. Caporali, H. Lancioni, S. Secomandi, G.R. Gallo, A. Costanzo, A. Romano, M. Garofalo, C. Cereda, V. Carelli, L. Gillespie, Y. Liu, Y. Kiat, A. Marzal, C. López-Calderón, J. Balbontín, T.A. Mousseau, P. Matyjasiak, A.P. Møller, O. Semino, R. Ambrosini, A. Bonisoli-Alquati, D. Rubolini, L. Ferretti, A. Achilli, L. Gianfranceschi, A. Olivieri, A. Torroni
CHROMOSOME-LEVEL DE NOVO GENOME ASSEMBLIES OF AVIAN SPECIES AND THEIR RELEVANCE FOR COMPARATIVE GENOMICS, PANGENOMICS, POPULATION GENOMICS AND SPECIES CONSERVATION.
2022 S. Secomandi
Pangenomics provides insights into the role of synanthropy in barn swallow evolution
2022 S. Secomandi, G. Gallo, M. Sozzoni, A. Iannucci, E. Galati, L. Abueg, J. Balacco, M. Caprioli, W. Chow, C. Ciofi, J. Collins, O. Fedrigo, L. Ferretti, A. Fungtammasan, B. Haase, K. Howe, W. Kwak, G. Lombardo, P. Masterson, G. Messina, A. Møller, J. Mountcastle, T. Mousseau, J. Ferrer-Obiol, A. Olivieri, A. Rhie, D. Rubolini, M. Saclier, R. Stanyon, D. Stucki, F. Thibaud-Nissen, J. Torrance, A. Torroni, K. Weber, R. Ambrosini, A. Bonisoli-Alquati, E. Jarvis, L. Gianfranceschi, G. Formenti
The era of reference genomes in conservation genomics
2022 G. Formenti, K. Theissinger, C. Fernandes, I. Bista, A. Bombarely, C. Bleidorn, C. Ciofi, A. Crottini, J.A. Godoy, J. Hoglund, J. Malukiewicz, A. Mouton, R.A. Oomen, S. Paez, P.J. Palsboll, C. Pampoulie, M.J. Ruiz-Lopez, H. Svardal, C. Theofanopoulou, J. de Vries, A.-. Waldvogel, G. Zhang, C.J. Mazzoni, E.D. Jarvis, M. Balint, F. Ciampor, J. Hoglund, P. Palsboll, M.J. Ruiz-Lopez, G. Zhang, E. Jarvis, S.A. Aghayan, T.S. Alioto, I. Almudi, N. Alvarez, P.C. Alves, I.R. Amorim, A. Antunes, P. Arribas, P. Baldrian, P.R. Berg, G. Bertorelle, A. Bohne, A. Bonisoli-Alquati, L.L. Bostjancic, B. Boussau, C.M. Breton, E. Buzan, P.F. Campos, C. Carreras, L.F. Castro, L.J. Chueca, E. Conti, R. Cook-Deegan, D. Croll, M.V. Cunha, F. Delsuc, A.B. Dennis, D. Dimitrov, R. Faria, A. Favre, O.D. Fedrigo, R. Fernandez, G.F. Ficetola, J.-. Flot, T. Gabaldon, D.R. Galea Agius, G.R. Gallo, A.M. Giani, M.T.P. Gilbert, T. Grebenc, K. Guschanski, R. Guyot, B. Hausdorf, O. Hawlitschek, P.D. Heintzman, B. Heinze, M. Hiller, M. Husemann, A. Iannucci, I. Irisarri, K.S. Jakobsen, S. Jentoft, P. Klinga, A. Kloch, C.F. Kratochwil, H. Kusche, K.K.S. Layton, J.A. Leonard, E. Lerat, G. Liti, T. Manousaki, T. Marques-Bonet, P. Matos-Maravi, M. Matschiner, F. Maumus, A.M. Mc Cartney, S. Meiri, J. Melo-Ferreira, X. Mengual, M.T. Monaghan, M. Montagna, R.W. Myslajek, M.T. Neiber, V. Nicolas, M. Novo, P. Ozretic, F. Palero, L. Parvulescu, M. Pascual, O.S. Paulo, M. Pavlek, C. Pegueroles, L. Pellissier, G. Pesole, C.R. Primmer, A. Riesgo, L. Ruber, D. Rubolini, D. Salvi, O. Seehausen, M. Seidel, S. Secomandi, B. Studer, S. Theodoridis, M. Thines, L. Urban, A. Vasemagi, A. Vella, N. Vella, S.C. Vernes, C. Vernesi, D.R. Vieites, R.M. Waterhouse, C.W. Wheat, G. Worheide, Y. Wurm, G. Zammit
Barn swallow pangenomics provides insights into the evolution of synanthropy
2022 G. Gallo, S. Secomandi, M. Sozzoni, R. Ambrosini, A. Bonisoli-Alquati, L. Gianfranceschi, G. Formenti
Telomere shortening is associated with corticosterone stress response in adult barn swallows
2022 A. Costanzo, R. Ambrosini, M. Parolini, M. Caprioli, S. Secomandi, D. Rubolini, L. Fusani, V. Canoine
Evolutionary insights from a barn swallow chromosome-level assembly
2021 S. Secomandi, G. Gallo, M. Sozzoni, R. Ambrosini, A. Bonisoli-Alquati, L. Gianfranceschi, G. Formenti
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species
2021 A. Rhie, S.A. Mccarthy, O. Fedrigo, J. Damas, G. Formenti, S. Koren, M. Uliano-Silva, W. Chow, A. Fungtammasan, J. Kim, C. Lee, B.J. Ko, M. Chaisson, G.L. Gedman, L.J. Cantin, F. Thibaud-Nissen, L. Haggerty, I. Bista, M. Smith, B. Haase, J. Mountcastle, S. Winkler, S. Paez, J. Howard, S.C. Vernes, T.M. Lama, F. Grutzner, W.C. Warren, C.N. Balakrishnan, D. Burt, J.M. George, M.T. Biegler, D. Iorns, A. Digby, D. Eason, B. Robertson, T. Edwards, M. Wilkinson, G. Turner, A. Meyer, A.F. Kautt, P. Franchini, H.W. Detrich, H. Svardal, M. Wagner, G.J.P. Naylor, M. Pippel, M. Malinsky, M. Mooney, M. Simbirsky, B.T. Hannigan, T. Pesout, M. Houck, A. Misuraca, S.B. Kingan, R. Hall, Z. Kronenberg, I. Sović, C. Dunn, Z. Ning, A. Hastie, J. Lee, S. Selvaraj, R.E. Green, N.H. Putnam, I. Gut, J. Ghurye, E. Garrison, Y. Sims, J. Collins, S. Pelan, J. Torrance, A. Tracey, J. Wood, R.E. Dagnew, D. Guan, S.E. London, D.F. Clayton, C.V. Mello, S.R. Friedrich, P.V. Lovell, E. Osipova, F.O. Al-Ajli, S. Secomandi, H. Kim, C. Theofanopoulou, M. Hiller, Y. Zhou, R.S. Harris, K.D. Makova, P. Medvedev, J. Hoffman, P. Masterson, K. Clark, F. Martin, K. Howe, P. Flicek, B.P. Walenz, W. Kwak, H. Clawson, M. Diekhans, L. Nassar, B. Paten, R.H.S. Kraus, A.J. Crawford, M.T.P. Gilbert, G. Zhang, B. Venkatesh, R.W. Murphy, K. Koepfli, B. Shapiro, W.E. Johnson, F. Di Palma, T. Marques-Bonet, E.C. Teeling, T. Warnow, J.M. Graves, O.A. Ryder, D. Haussler, S.J. O'Brien, J. Korlach, H.A. Lewin, K. Howe, E.W. Myers, R. Durbin, A.M. Phillippy, E.D. Jarvis
The genome sequence of the European nightjar, Caprimulgus europaeus (Linnaeus, 1758)
2021 S. Secomandi, F. Spina, G. Formenti, G.R. Gallo, M. Caprioli, R. Ambrosini, S. Riello
Prenatal independent and combined effects of yolk Vitamin E and corticosterone on embryo growth and oxidative status in the yellow-legged gull
2019 M. Parolini, C.D. Possenti, S. Secomandi, S. Carboni, M. Caprioli, D. Rubolini, A. Romano, N. Saino
Independent and combined effects of egg pro- and anti-oxidants on gull chick phenotype
2018 C.D. Possenti, S. Secomandi, A. Schiavon, M. Caprioli, D. Rubolini, A. Romano, N. Saino, M. Parolini