Gene-wide analysis detects two new susceptibility genes for Alzheimer's disease

Escott Price, V.; Bellenguez, C.; Wang, L.; Choi, S.; Harold, D.; Jones, L.; Holmans, P.; Gerrish, A.; Vedernikov, A.; Richards, A.; Destefano, A.L.; Lambert, J.; Ibrahim Verbaas, C.A.; Naj, A.C.; Sims, R.; Jun, G.; Bis, J.C.; Beecham, G.W.; Grenier Boley, B.; Russo, G.; Thornton Wells, T.A.; Denning, N.; Smith, A.V.; Chouraki, V.; Thomas, C.; Arfan Ikram, M.; Zelenika, D.; Vardarajan, B.N.; Kamatani, Y.; Lin, C.; Schmidt, H.; Kunkle, B.; Dunstan, M.L.; Vronskaya, M.; Johnson, A.D.; Ruiz, A.; Bihoreau, M.; Reitz, C.; Pasquier, F.; Hollingworth, P.; Hanon, O.; Fitzpatrick, A.L.; Buxbaum, J.D.; Campion, D.; Crane, P.K.; Becker, C.B.T.; Gudnason, V.; Cruchaga, C.; Craig, D.; Amin, N.; Berr, C.; Lopez, O.L.; De Jager, P.L.; Deramecourt, V.; Johnston, J.A.; Evans, D.; Lovestone, S.; Letenneur, L.; Hernández, I.; Rubinsztein, D.C.; Eiriksdottir, G.; Sleegers, K.; Goate, A.M.; Fiévet, N.; Huentelman, M.J.; Gill, M.; Brown, K.; Kamboh, M..I.; Keller, L.; Barberger Gateau, P.; Mcguinness, B.; Larson, E.B.; Myers, A.J.; Dufouil, C.; Todd, S.; Wallon, D.; Love, S.; Rogaeva, E.; Gallacher, J.; St George Hyslop, P.; Clarimon, J.; Lleo, A.; Bayer, A.; Tsuang, D.W.; Yu, L.; Tsolaki, M.; Bossù, P.; Spalletta, G.; Proitsi, P.; Collinge, J.; Sorbi, S.; Sanchez Garcia, F.; Fox, N.C.; Hardy, J.; Naranjo, M.C.D.; Bosco, P.; Clarke, R.; Brayne, C.; Galimberti, D.; Scarpini, E.; Bonuccelli, U.; Mancuso, M.; Siciliano, G.; Moebus, S.; Mecocci, P.; Del Zompo, M.; Maier, W.; Hampel, H.; Pilotto, A.; Frank García, A.; Panza, F.; Solfrizzi, V.; Caffarra, P.; Nacmias, B.; Perry, W.; Mayhaus, M.; Lannfelt, L.; Hakonarson, H.; Pichler, S.; Carrasquillo, M.M.; Ingelsson, M.; Beekly, D.; Alvarez, V.; Zou, F.; Valladares, O.; Younkin, S.G.; Coto, E.; Hamilton Nelson, K.L.; Gu, W.; Razquin, C.; Pastor, P.; Mateo, I.; Owen, M.J.; Faber, K.M.; Jonsson, P.V.; Combarros, O.; O'Donovan, M.C.; Cantwell, L.B.; Soininen, H.; Blacker, D.; Mead, S.; T. H. Mosley J. r.,; Bennett, D.A.; Harris, T.B.; Fratiglioni, L.; Holmes, C.; De Bruijn, R.F..A..G.; Passmore, P.; Montine, T.J.; Bettens, K.; Rotter, J.I.; Brice, A.; Morgan, K.; Foroud, T.M.; Kukull, W.A.; Hannequin, D.; Powell, J.F.; Nalls, M.A.; Ritchie, K.; Lunetta, K.L.; Kauwe, J.S..K.; Boerwinkle, E.; Riemenschneider, M.; Boada, M.; Hiltunen, M.; Martin, E.R.; Schmidt, R.; Rujescu, D.; Dartigues, J.; Mayeux, R.; Tzourio, C.; Hofman, A.; Nöthen, M.M.; Graff, C.; Psaty, B.M.; Haines, J.L.; Lathrop, M.; Pericak Vance, M.A.; Launer, L.J.; Van Broeckhoven, C.; Farrer, L.A.; Van Duijn, C.M.; Ramirez, A.; Seshadri, S.; Schellenberg, G.D.; Amouyel, P.; Williams, J.

doi:10.1371/journal.pone.0094661

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Background: Alzheimer's disease is a common debilitating dementia with known heritability, for which 20 late onset susceptibility loci have been identified, but more remain to be discovered. This study sought to identify new susceptibility genes, using an alternative gene-wide analytical approach which tests for patterns of association within genes, in the powerful genome-wide association dataset of the International Genomics of Alzheimer's Project Consortium, comprising over 7 m genotypes from 25,580 Alzheimer's cases and 48,466 controls. Principal Findings: In addition to earlier reported genes, we detected genome-wide significant loci on chromosomes 8 (TP53INP1, p = 1.4×10-6) and 14 (IGHV1-67 p = 7.9×10-8) which indexed novel susceptibility loci. Significance: The additional genes identified in this study, have an array of functions previously implicated in Alzheimer's disease, including aspects of energy metabolism, protein degradation and the immune system and add further weight to these pathways as potential therapeutic targets in Alzheimer's disease.

Titolo:	Gene-wide analysis detects two new susceptibility genes for Alzheimer's disease
Autori:	V. Escott Price C. Bellenguez L. Wang S. Choi D. Harold L. Jones P. Holmans A. Gerrish A. Vedernikov A. Richards A. L. DeStefano J. Lambert C. A. Ibrahim Verbaas A. C. Naj R. Sims G. Jun J. C. Bis G. W. Beecham B. Grenier Boley G. Russo T. A. Thornton Wells N. Denning A. V. Smith V. Chouraki C. Thomas M. Arfan Ikram D. Zelenika B. N. Vardarajan Y. Kamatani C. Lin H. Schmidt B. Kunkle M. L. Dunstan M. Vronskaya A. D. Johnson A. Ruiz M. Bihoreau C. Reitz F. Pasquier P. Hollingworth O. Hanon A. L. Fitzpatrick J. D. Buxbaum D. Campion P. K. Crane C. B. T. Becker V. Gudnason C. Cruchaga D. Craig N. Amin C. Berr O. L. Lopez P. L. De Jager V. Deramecourt J. A. Johnston D. Evans S. Lovestone L. Letenneur I. Hernández D. C. Rubinsztein G. Eiriksdottir K. Sleegers A. M. Goate N. Fiévet M. J. Huentelman M. Gill K. Brown M. . I. Kamboh L. Keller P. Barberger Gateau B. McGuinness E. B. Larson A. J. Myers C. Dufouil S. Todd D. Wallon S. Love E. Rogaeva J. Gallacher P. St George Hyslop J. Clarimon A. Lleo A. Bayer D. W. Tsuang L. Yu M. Tsolaki P. Bossù G. Spalletta P. Proitsi J. Collinge S. Sorbi F. Sanchez Garcia N. C. Fox J. Hardy M. C. D. Naranjo P. Bosco R. Clarke C. Brayne GALIMBERTI, DANIELA SCARPINI, ELIO ANGELO U. Bonuccelli M. Mancuso G. Siciliano S. Moebus P. Mecocci M. Del Zompo W. Maier H. Hampel A. Pilotto A. Frank García F. Panza V. Solfrizzi P. Caffarra B. Nacmias W. Perry M. Mayhaus L. Lannfelt H. Hakonarson S. Pichler M. M. Carrasquillo M. Ingelsson D. Beekly V. Alvarez F. Zou O. Valladares S. G. Younkin E. Coto K. L. Hamilton Nelson W. Gu C. Razquin P. Pastor I. Mateo M. J. Owen K. M. Faber P. V. Jonsson O. Combarros M. C. O'Donovan L. B. Cantwell H. Soininen D. Blacker S. Mead T. H. Mosley J.r. D. A. Bennett T. B. Harris L. Fratiglioni C. Holmes R. F. . A. . G. De Bruijn P. Passmore T. J. Montine K. Bettens J. I. Rotter A. Brice K. Morgan T. M. Foroud W. A. Kukull D. Hannequin J. F. Powell M. A. Nalls K. Ritchie K. L. Lunetta J. S. . K. Kauwe E. Boerwinkle M. Riemenschneider M. Boada M. Hiltunen E. R. Martin R. Schmidt D. Rujescu J. Dartigues R. Mayeux C. Tzourio A. Hofman M. M. Nöthen C. Graff B. M. Psaty J. L. Haines M. Lathrop M. A. Pericak Vance L. J. Launer C. Van Broeckhoven L. A. Farrer C. M. Van Duijn A. Ramirez S. Seshadri G. D. Schellenberg P. Amouyel J. Williams mostra contributor esterni nascondi contributor esterni
Parole Chiave:	Agricultural and Biological Sciences (all); Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (all); Medicine (all)
Settore Scientifico Disciplinare:	Settore MED/26 - Neurologia
Data di pubblicazione:	giu-2014
Rivista:	PLOS ONE
Tipologia:	Article (author)
Digital Object Identifier (DOI):	10.1371/journal.pone.0094661
Appare nelle tipologie:	01 - Articolo su periodico

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http://hdl.handle.net/2434/248952

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