International genome-wide meta-analysis identifies new primary biliary cirrhosis risk loci and targetable pathogenic pathways

Cordell, H.J.; Han, Y.; Mells, G.F.; Li, Y.; Hirschfield, G.M.; Greene, C.S.; Xie, G.; Juran, B.D.; Zhu, D.; Qian, D.C.; Floyd, J.A.B.; Morley, K.I.; Prati, D.; Lleo, A.; Cusi, D.; Gershwin, M.E.; Anderson, C.A.; Lazaridis, K.N.; Invernizzi, P.; Seldin, M.F.; Sandford, R.N.; Amos, C.I.; Siminovitch, K.A.; Schlicht, E.M.; Lammert, C.; Atkinson, E.J.; Chan, L.L.; De Andrade, M.; Balschun, T.; Mason, A.L.; Myers, R.P.; Zhang, J.; Milkiewicz, P.; Qu, J.; Odin, J.A.; Luketic, V.A.; Bacon, B.R.; Bodenheimer, H.C.; Liakina, V.; Vincent, C.; Levy, C.; Gregersen, P.K.; Almasio, P.L.; Alvaro, D.; Andreone, P.; Andriulli, A.; Barlassina, C.; Battezzati, P.M.; Benedetti, A.; Bernuzzi, F.; Bianchi, I.; Bragazzi, M.C.; Brunetto, M.; Bruno, S.; Casella, G.; Coco, B.; Colli, A.; Colombo, M.; Colombo, S.; Cursaro, C.; Croce, L.S.; Crosignani, A.; Donato, M.F.; Elia, G.; Fabris, L.; Ferrari, C.; Floreani, A.; Foglieni, B.; Fontana, R.; Galli, A.; Lazzari, R.; Macaluso, F.; Malinverno, F.; Marra, F.; Marzioni, M.; Mattalia, A.; Montanari, R.; Morini, L.; Morisco, F.; Mousa Hani, S.; Muratori, L.; Muratori, P.; Niro, G.A.; Palmieri, V.O.; Picciotto, A.; Podda, M.; Portincasa, P.; Ronca, V.; Rosina, F.; Rossi, S.; Sogno, I.; Spinzi, G.; Spreafico, M.; Strazzabosco, M.; Tarallo, S.; Tarocchi, M.; Tiribelli, C.; Toniutto, P.; Vinci, M.; Zuin, M.; Ch'Ng, C.L.; Rahman, M.; Yapp, T.; Sturgess, R.; Healey, C.; Czajkowski, M.; Gunasekera, A.; Gyawali, P.; Premchand, P.; Kapur, K.; Marley, R.; Foster, G.; Watson, A.; Dias, A.; Subhani, J.; Harvey, R.; Mccorry, R.; Ramanaden, D.; Gasem, J.; Evans, R.; Mathialahan, T.; Shorrock, C.; Lipscomb, G.; Southern, P.; Tibble, J.; Gorard, D.; Palegwala, A.; Jones, S.; Carbone, M.; Dawwas, M.; Alexander, G.; Dolwani, S.; Prince, M.; Foxton, M.; Elphick, D.; Mitchison, H.; Gooding, I.; Karmo, M.; Saksena, S.; Mendall, M.; Patel, M.; Ede, R.; Austin, A.; Sayer, J.; Hankey, L.; Hovell, C.; Fisher, N.; Carter, M.; Koss, K.; Piotrowicz, A.; Grimley, C.; Neal, D.; Lim, G.; Levi, S.; Ala, A.; Broad, A.; Saeed, A.; Wood, G.; Brown, J.; Wilkinson, M.; Gordon, H.; Ramage, J.; Ridpath, J.; Ngatchu, T.; Grover, B.; Shaukat, S.; Shidrawi, R.; Abouda, G.; Ali, F.; Rees, I.; Salam, I.; Narain, M.; Brown, A.; Taylor-Robinson, S.; Williams, S.; Grellier, L.; Banim, P.; Das, D.; Chilton, A.; Heneghan, M.; Curtis, H.; Gess, M.; Drake, I.; Aldersley, M.; Davies, M.; Jones, R.; Mcnair, A.; Srirajaskanthan, R.; Pitcher, M.; Sen, S.; Bird, G.; Barnardo, A.; Kitchen, P.; Yoong, K.; Chirag, O.; Sivaramakrishnan, N.; Macfaul, G.; Jones, D.; Shah, A.; Evans, C.; Saha, S.; Pollock, K.; Bramley, P.; Mukhopadhya, A.; Fraser, A.; Mills, P.; Shallcross, C.; Campbell, S.; Bathgate, A.; Shepherd, A.; Dillon, J.; Rushbrook, S.; Przemioslo, R.; Macdonald, C.; Metcalf, J.; Shmueli, U.; Davis, A.; Naqvi, A.; Lee, T.; Stephen, D.; Collier, J.; Klass, H.; Ninkovic, M.; Cramp, M.; Sharer, N.; Aspinall, R.; Goggin, P.; Ghosh, D.; Douds, A.; Hoeroldt, B.; Booth, J.; Williams, E.; Hussaini, H.; Stableforth, W.; Ayres, R.; Thorburn, D.; Marshall, E.; Burroughs, A.; Mann, S.; Lombard, M.; Richardson, P.; Patanwala, I.; Maltby, J.; Brookes, M.; Mathew, R.; Vyas, S.; Singhal, S.; Gleeson, D.; Misra, S.; Butterworth, J.; George, K.; Harding, T.; Douglass, A.; Panter, S.; Shearman, J.; Bray, G.; Butcher, G.; Forton, D.; Mclindon, J.; Cowan, M.; Whatley, G.; Mandal, A.; Gupta, H.; Sanghi, P.; Jain, S.; Pereira, S.; Prasad, G.; Watts, G.; Wright, M.; Neuberger, J.; Gordon, F.; Unitt, E.; Grant, A.; Delahooke, T.; Higham, A.; Brind, A.; Cox, M.; Ramakrishnan, S.; King, A.; Collins, C.; Whalley, S.; Li, A.; Fraser, J.; Bell, A.; Wong, V.S.; Singhal, A.; Gee, I.; Ang, Y.; Ransford, R.; Gotto, J.; Millson, C.; Bowles, J.; Thomas, C.; Harrison, M.; Galaska, R.; Kendall, J.; Whiteman, J.; Lawlor, C.; Gray, C.; Elliott, K.; Mulvaney-Jones, C.; Hobson, L.; Van Duyvenvoorde, G.; Loftus, A.; Seward, K.; Penn, R.; Maiden, J.; Damant, R.; Hails, J.; Cloudsdale, R.; Silvestre, V.; Glenn, S.; Dungca, E.; 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doi:10.1038/ncomms9019

Primary biliary cirrhosis (PBC) is a classical autoimmune liver disease for which effective immunomodulatory therapy is lacking. Here we perform meta-analyses of discovery data sets from genome-wide association studies of European subjects (n=2,764 cases and 10,475 controls) followed by validation genotyping in an independent cohort (n=3,716 cases and 4,261 controls). We discover and validate six previously unknown risk loci for PBC (Pcombined <5 × 10-8) and used pathway analysis to identify JAK-STAT/IL12/IL27 signalling and cytokine-cytokine pathways, for which relevant therapies exist.

International genome-wide meta-analysis identifies new primary biliary cirrhosis risk loci and targetable pathogenic pathways / H.J. Cordell, Y.H.. - In: NATURE COMMUNICATIONS. - ISSN 2041-1723. - 6:(2015), pp. 8019.1-8019.11. [10.1038/ncomms9019]

International genome-wide meta-analysis identifies new primary biliary cirrhosis risk loci and targetable pathogenic pathways

Cordell H. J.;Han Y.;Mells G. F.;Li Y.;Hirschfield G. M.;Greene C. S.;Xie G.;Juran B. D.;Zhu D.;Qian D. C.;Floyd J. A. B.;Morley K. I.;Prati D.;A. Lleo;D. Cusi;Gershwin M. E.;Anderson C. A.;Lazaridis K. N.;Invernizzi P.;Seldin M. F.;Sandford R. N.;Amos C. I.;Siminovitch K. A.;Schlicht E. M.;Lammert C.;Atkinson E. J.;Chan L. L.;De Andrade M.;Balschun T.;Mason A. L.;Myers R. P.;J. Zhang;Milkiewicz P.;Qu J.;Odin J. A.;Luketic V. A.;Bacon B. R.;Bodenheimer H. C.;Liakina V.;Vincent C.;Levy C.;Gregersen P. K.;Almasio P. L.;Alvaro D.;Andreone P.;Andriulli A.;C. Barlassina;P.M. Battezzati;A. Benedetti;F. Bernuzzi;Bianchi I.;Bragazzi M. C.;Brunetto M.;Bruno S.;G. Casella;Coco B.;A. Colli;Colombo M.;Colombo S.;Cursaro C.;Croce L. S.;Crosignani A.;Donato M. F.;G. Elia;Fabris L.;Ferrari C.;Floreani A.;B. Foglieni;Fontana R.;Galli A.;Lazzari R.;Macaluso F.;F. Malinverno;F. Marra;Marzioni M.;Mattalia A.;Montanari R.;Morini L.;Morisco F.;Mousa Hani S.;Muratori L.;Muratori P.;Niro G. A.;Palmieri V. O.;Picciotto A.;M. Podda;Portincasa P.;V. Ronca;Rosina F.;Rossi S.;Sogno I.;Spinzi G.;Spreafico M.;Strazzabosco M.;Tarallo S.;Tarocchi M.;Tiribelli C.;Toniutto P.;Vinci M.;M. Zuin;Ch'Ng C. L.;Rahman M.;Yapp T.;Sturgess R.;Healey C.;Czajkowski M.;Gunasekera A.;Gyawali P.;Premchand P.;Kapur K.;Marley R.;Foster G.;Watson A.;A. Dias;Subhani J.;Harvey R.;McCorry R.;Ramanaden D.;Gasem J.;Evans R.;Mathialahan T.;Shorrock C.;Lipscomb G.;Southern P.;Tibble J.;Gorard D.;Palegwala A.;Jones S.;Carbone M.;Dawwas M.;Alexander G.;Dolwani S.;Prince M.;Foxton M.;Elphick D.;Mitchison H.;Gooding I.;Karmo M.;Saksena S.;Mendall M.;Patel M.;Ede R.;Austin A.;Sayer J.;Hankey L.;Hovell C.;Fisher N.;Carter M.;Koss K.;Piotrowicz A.;Grimley C.;Neal D.;Lim G.;S. Levi;Ala A.;Broad A.;Saeed A.;Wood G.;Brown J.;Wilkinson M.;Gordon H.;Ramage J.;Ridpath J.;Ngatchu T.;Grover B.;Shaukat S.;Shidrawi R.;Abouda G.;Ali F.;Rees I.;Salam I.;Narain M.;Brown A.;Taylor-Robinson S.;Williams S.;Grellier L.;Banim P.;Das D.;Chilton A.;Heneghan M.;Curtis H.;Gess M.;Drake I.;Aldersley M.;Davies M.;R. Jones;McNair A.;Srirajaskanthan R.;Pitcher M.;Sen S.;Bird G.;Barnardo A.;Kitchen P.;Yoong K.;Chirag O.;Sivaramakrishnan N.;MacFaul G.;D. Jones;Shah A.;Evans C.;Saha S.;Pollock K.;Bramley P.;Mukhopadhya A.;Fraser A.;Mills P.;Shallcross C.;S. Campbell;Bathgate A.;Shepherd A.;Dillon J.;Rushbrook S.;Przemioslo R.;Macdonald C.;Metcalf J.;Shmueli U.;Davis A.;Naqvi A.;Lee T.;Stephen D.;Collier J.;Klass H.;Ninkovic M.;Cramp M.;Sharer N.;Aspinall R.;Goggin P.;Ghosh D.;Douds A.;Hoeroldt B.;Booth J.;Williams E.;Hussaini H.;Stableforth W.;Ayres R.;Thorburn D.;Marshall E.;Burroughs A.;Mann S.;Lombard M.;Richardson P.;Patanwala I.;Maltby J.;Brookes M.;Mathew R.;Vyas S.;Singhal S.;Gleeson D.;Misra S.;Butterworth J.;George K.;Harding T.;Douglass A.;Panter S.;Shearman J.;Bray G.;Butcher G.;Forton D.;McLindon J.;Cowan M.;Whatley G.;Mandal A.;Gupta H.;Sanghi P.;Jain S.;Pereira S.;Prasad G.;Watts G.;Wright M.;Neuberger J.;Gordon F.;Unitt E.;Grant A.;Delahooke T.;Higham A.;Brind A.;Cox M.;Ramakrishnan S.;King A.;Collins C.;Whalley S.;A. Li;Fraser J.;A. Bell;Wong V. S.;Singhal A.;Gee I.;Ang Y.;Ransford R.;Gotto J.;Millson C.;Bowles J.;Thomas C.;Harrison M.;Galaska R.;Kendall J.;Whiteman J.;Lawlor C.;Gray C.;Elliott K.;Mulvaney-Jones C.;Hobson L.;Van Duyvenvoorde G.;Loftus A.;Seward K.;Penn R.;Maiden J.;Damant R.;Hails J.;Cloudsdale R.;Silvestre V.;Glenn S.;Dungca E.;Wheatley N.;Doyle H.;Kent M.;Hamilton C.;Braim D.;Wooldridge H.;Abrahams R.;Paton A.;Lancaster N.;Gibbins A.;Hogben K.;Desousa P.;Muscariu F.;Musselwhite J.;McKay A.;Tan L.;Foale C.;Brighton J.;Flahive K.;Nambela E.;Townshend P.;Ford C.;Holder S.;Palmer C.;Featherstone J.;Nasseri M.;Sadeghian J.;Williams B.;Thomas C.;Rolls S. -A.;Hynes A.;Duggan C.;Jones S.;Crossey M.;Stansfield G.;MacNicol C.;Wilkins J.;Wilhelmsen E.;Raymode P.;Lee H. -J.;Durant E.;Bishop R.;Ncube N.;Tripoli S.;Casey R.;Cowley C.;Miller R.;Houghton K.;Ducker S.;Wright F.;Bird B.;Baxter G.;Keggans J.;Hughes M.;Grieve E.;Young K.;Williams D.;Ocker K.;Hines F.;Martin K.;Innes C.;Valliani T.;Fairlamb H.;Thornthwaite S.;Eastick A.;Tanqueray E.;Morrison J.;Holbrook B.;Browning J.;Walker K.;Congreave S.;Verheyden J.;Slininger S.;Stafford L.;O'Donnell D.;Ainsworth M.;Lord S.;Kent L.;March L.;Dickson C.;Simpson D.;Longhurst B.;Hayes M.;Shpuza E.;White N.;Besley S.;Pearson S.;Wright A.;Jones L.;Gunter E.;Dewhurst H.;Fouracres A.;Farrington L.;Graves L.;Marriott S.;Leoni M.;Tyrer D.;Martin K.;Dali-Kemmery L.;Lambourne V.;Green M.;Sirdefield D.;Amor K.;Colley J.;Shinder B.;J. Jones;Mills M.;Carnahan M.;Taylor N.;Boulton K.;Tregonning J.;Brown C.;Clifford G.;Archer E.;Hamilton M.;Curtis J.;Shewan T.;Walsh S.;Warner K.;Netherton K.;Mupudzi M.;Gunson B.;Gitahi J.;Gocher D.;Batham S.;Pateman H.;Desmennu S.;Conder J.;Clement D.;Gallagher S.;Orpe J.;Chan P.;Currie L.;O'Donohoe L.;Oblak M.;Morgan L.;Quinn M.;Amey I.;Baird Y.;Cotterill D.;Cumlat L.;Winter L.;Greer S.;Spurdle K.;Allison J.;Dyer S.;Sweeting H.;Kordula J.

2015

Abstract

Primary biliary cirrhosis (PBC) is a classical autoimmune liver disease for which effective immunomodulatory therapy is lacking. Here we perform meta-analyses of discovery data sets from genome-wide association studies of European subjects (n=2,764 cases and 10,475 controls) followed by validation genotyping in an independent cohort (n=3,716 cases and 4,261 controls). We discover and validate six previously unknown risk loci for PBC (Pcombined <5 × 10-8) and used pathway analysis to identify JAK-STAT/IL12/IL27 signalling and cytokine-cytokine pathways, for which relevant therapies exist.

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	Parole chiave
	
				Susceptibility loci; association; variants; population; imputation; genotypes; elements; database; traits; server
			
	Settori scientifico-disciplinari dell'articolo (sola visualizzazione)
	
				Settore MED/12 - Gastroenterologia
			
	Data di pubblicazione
	
				2015
			
	Rivista in ANCE
	
				NATURE COMMUNICATIONS
			
	DOI
	
				https://dx.doi.org/10.1038/ncomms9019
			
	Tipologia
	
				Article (author)
			
	Appare nelle tipologie:
	
				01 - Articolo su periodico

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