Annotated draft genomic sequence from a Streptococcus pneumoniae type 19F clinical isolate

Dopazo, J.; Mendoza, A.; Herrero, J.; Caldara, F.; Humbert, Y.; Friedli, L.; Guerrier, M.; Grand-Schenk, E.; Gandin, C.; de Francesco, M.; Polissi, A.; Buell, G.; Feger, G.; García, E.; Peitsch, M.; García-Bustos, J.F.

doi:10.1089/10766290152044995

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The public availability of numerous microbial genomes is enabling the analysis of bacterial biology in great detail and with an unprecedented, organism-wide and taxon-wide, broad scope. Streptococcus pneumoniae is one of the most important bacterial pathogens throughout the world. We present here sequences and functional annotations for 2.1-Mbp of pneumococcal DNA, covering more than 90% of the total estimated size of the genome. The sequenced strain is a clinical isolate resistant to macrolides and tetracycline. It carries a type 19F capsular locus, but multilocus sequence typing for several conserved genetic loci suggests that the strain sequenced belongs to a pneumococcal lineage that most often expresses a serotype 15 capsular polysaccharide. A total of 2,046 putative open reading frames (ORFs) longer than 100 amino acids were identified (average of 1,009 bp per ORF), including all described two-component systems and aminoacyl tRNA synthetases. Comparisons to other complete, or nearly complete, bacterial genomes were made and are presented in a graphical form for all the predicted proteins.

Annotated draft genomic sequence from a Streptococcus pneumoniae type 19F clinical isolate / J. Dopazo, A. Mendoza, J. Herrero, F. Caldara, Y. Humbert, L. Friedli, M. Guerrier, E. Grand-Schenk, C. Gandin, M. de Francesco, A. Polissi, G. Buell, G. Feger, E. García, M. Peitsch, J.F. García-Bustos. - In: MICROBIAL DRUG RESISTANCE. - ISSN 1076-6294. - 7:2(2001), pp. 99-125.

Titolo:	Annotated draft genomic sequence from a Streptococcus pneumoniae type 19F clinical isolate
Autori:	Dopazo, J Mendoza, A Herrero, J Caldara, F Humbert, Y Friedli, L Guerrier, M Grand-Schenk, E Gandin, C de Francesco, M POLISSI, ALESSANDRA Buell, G Feger, G García, E Peitsch, M García-Bustos, J F mostra contributor esterni nascondi contributor esterni
Parole Chiave:	Conjugative transposon TN5252; nucleotide-sequence; gene; identification; transformation; resistance; tool
Settore Scientifico Disciplinare:	Settore BIO/19 - Microbiologia Generale
Data di pubblicazione:	2001
Rivista:	MICROBIAL DRUG RESISTANCE
Tipologia:	Article (author)
Digital Object Identifier (DOI):	http://dx.doi.org/10.1089/10766290152044995
Appare nelle tipologie:	01 - Articolo su periodico

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http://hdl.handle.net/2434/611259

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