Viruses infecting marine picoplancton encode functional potassium ion channels

Siotto, F.; Martin, C.; Rauh, O.; Van Etten, J.L.; Schroeder, I.; Moroni, A.; Thiel, G.

doi:10.1016/j.virol.2014.05.002

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Phycodnaviruses are dsDNA viruses, which infect algae. Their large genomes encode many gene products, like small K+channels, with homologs in prokaryotes and eukaryotes. Screening for K+channels revealed their abundance in viruses from fresh-water habitats. Recent sequencing of viruses from marine algae or from salt water in Antarctica revealed sequences with the predicted characteristics of K+channels but with some unexpected features. Two genes encode either 78 or 79 amino acid proteins, which are the smallest known K+channels. Also of interest is an unusual sequence in the canonical α-helixes in K+channels. Structural prediction algorithms indicate that the new channels have the conserved α-helix folds but the algorithms failed to identify the expected transmembrane domains flanking the K+channel pores. In spite of these unexpected properties electophysiological studies confirmed that the new proteins are functional K+channels.

Titolo:	Viruses infecting marine picoplancton encode functional potassium ion channels
Autori:	Siotto, Fenja Martin, Corinna Rauh, Oliver Van Etten, James L. SCHROEDER, INDRA MORONI, ANNA Thiel, Gerhard mostra contributor esterni nascondi contributor esterni
Parole Chiave:	K+ channel evolution; Kcv; Chlorella viruses; Algal viruses; Virus evolution
Settore Scientifico Disciplinare:	Settore BIO/04 - Fisiologia Vegetale
Data di pubblicazione:	2014
Rivista:	VIROLOGY
Tipologia:	Article (author)
Digital Object Identifier (DOI):	10.1016/j.virol.2014.05.002
Appare nelle tipologie:	01 - Articolo su periodico

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1-s2.0-S0042682214002128-main.pdf		Publisher's version/PDF		Open Access Visualizza/Apri

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http://hdl.handle.net/2434/585472

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