Single-nucleotide polymorphism-defined class I and class III major histocompatibility complex genetic subregions contribute to natural long-term nonprogression in HIV infection

Guergnon J, D.C.; Broet, P.; Meyer, L.; Westrop, S.; Imami, N.; Vicenzi, E.; Morsica, G.; Tinelli, M.; Zanone Poma, B.; Goujard, C.; Potard, V.; Gotch, F.; Casoli, C.; Cossarizza, A.; Macciardi, F.; Debré, P.; Delfraissy, J.; Galli, M.; Autran, B.; Costagliola, D.; Poli, G.; Theodorou, I.; Riva, A.

doi:10.1093/infdis/jir833

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We performed a genome-wide association study comparing a cohort of 144 human immunodeficiency virus (HIV type 1-infected, untreated white long-term nonprogressors (LTNPs) with a cohort of 605 HIV-1-infected white seroconverters. Forty-seven single-nucleotide polymorphisms (SNPs), located from class I to class III major histocompatibility complex (MHC) subregions, show statistical association (false discovery rate, <0.05) with the LTNP condition, among which 5 reached genome-wide significance after Bonferonni correction. The MHC LTNP-associated SNPs are ordered in ≥4 linkage disequilibrium blocks; interestingly, an MHC class III linkage disequilibrium block (defined by the rs9368699 SNP) seems specific to the LTNP phenotype.

Single-nucleotide polymorphism-defined class I and class III major histocompatibility complex genetic subregions contribute to natural long-term nonprogression in HIV infection / D.C. Guergnon J, P. Broet, L. Meyer, S. Westrop, N. Imami, E. Vicenzi, G. Morsica, M. Tinelli, B. Zanone Poma, C. Goujard, V. Potard, F. Gotch, C. Casoli, A. Cossarizza, F. Macciardi, P. Debré, J. Delfraissy, M. Galli, B. Autran, D. Costagliola, G. Poli, I. Theodorou, A. Riva. - In: THE JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES. - ISSN 0022-1899. - 205:5(2012 Mar 01), pp. 718-724.

Titolo:	Single-nucleotide polymorphism-defined class I and class III major histocompatibility complex genetic subregions contribute to natural long-term nonprogression in HIV infection
Autori:	D. C. Guergnon J P. Broet L. Meyer S. Westrop N. Imami E. Vicenzi G. Morsica M. Tinelli ZANONE POMA, BARBARA C. Goujard V. Potard F. Gotch C. Casoli A. Cossarizza MACCIARDI, FABIO P. Debré J. Delfraissy GALLI, MASSIMO B. Autran D. Costagliola G. Poli I. Theodorou RIVA, AGOSTINO mostra contributor esterni nascondi contributor esterni
Parole Chiave:	genome-wide association; cells; determinants; expression; features; RNA
Settore Scientifico Disciplinare:	Settore MED/17 - Malattie Infettive
Data di pubblicazione:	1-mar-2012
Rivista:	THE JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES
Tipologia:	Article (author)
Digital Object Identifier (DOI):	http://dx.doi.org/10.1093/infdis/jir833
Appare nelle tipologie:	01 - Articolo su periodico

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