Complete nucleotide sequence of HTLV-II isolate RNA: comparison of envelope sequence variation of HTLV-II isolates from U.S. blood donors and U.S. and Italian IV drug users

Lee, H.; Idler, K.B.; Swanson, P.; Aparicio, J.J.; Kin, K.K.; Lax, J.P.; Nguyen, M.; Mann, T.; Leckie, G.; Zanetti, A.; Marinucci, G.; Chen, I.Y.; Rosenblatt, J.D.

doi:10.1006/viro.1993.1454

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The entire nucleotide sequence of human T-cell lymphotropic virus type II (HTLV-II) from a previously described isolate of patient NRA (HTLV-IINRA) was determined. Clones encoding the 5′ LTR and gag, pol, env and tax/rex open reading frames were subcloned and sequenced on both strands. The provirus consisted of 8957 nucleotides and showed 95.2% homology with the HTLV-IIMo prototype at the nucleotide level. Less than 5% amino acid variation between HTLV-IINRA and HTLV-IIMo was observed for coding regions. Although isolate HTLV-IINRA had an additional 25 amino acids at the 3′ end of the tax/rex, this region was 96% homologous with the 5′ end of HTLV-IIMo 3′ LTR. To further investigate HTLV-II variability, a portion of the env gp46 gene derived from 9 HTLV-II infected persons was amplified by polymerase chain reaction and sequenced. Sequenced was obtained for 320 nucleotides corresponding to HTLV-IIMo position 5291 to 5610. Isolates similar to the HTLV-IIMo and HTLV-IINRA prototypes were identified, and sequences were highly conserved.

Titolo:	Complete nucleotide sequence of HTLV-II isolate RNA: comparison of envelope sequence variation of HTLV-II isolates from U.S. blood donors and U.S. and Italian IV drug users
Autori:	H. LEE K. B. IDLER P. SWANSON J. J. APARICIO K. K. KIN J. P. LAX M. NGUYEN T. MANN G. LECKIE ZANETTI, ALESSANDRO REMO G. MARINUCCI I. Y. CHEN J. D. ROSENBLATT mostra contributor esterni nascondi contributor esterni
Settore Scientifico Disciplinare:	Settore MED/42 - Igiene Generale e Applicata
Data di pubblicazione:	1993
Rivista:	VIROLOGY
Tipologia:	Article (author)
Digital Object Identifier (DOI):	10.1006/viro.1993.1454
Appare nelle tipologie:	01 - Articolo su periodico

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http://hdl.handle.net/2434/185511

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