La regolazione dei flussi metabolici non può essere discussa senza considerare la termodinamica delle reazioni enzimatiche implicate. Reazioni vicino all'equilibrio richiederanno enzimi con grandi Vmax, mentre reazioni lontane dall'equilibrio richiederanno Vmax poco superiori al flusso nella via. Questo significa che gli aumenti di flusso saranno mediati spesso da aumenti/attivazioni parallele di enzimi. Ne consegue che la coregolazione dei trascritti può essere un utile strumento per analizzare la funzione dei geni coinvlti nel metabolismo. Saranno discussi alcuni esempi paradigmatici e la validità generale dell'approccio.

Tell me who your friends are and I'll tell what gene you are: coregulation analysis on microarray data from Arabidopsis / P. Morandini. ((Intervento presentato al 8. convegno Corso estivo di approfondimento sulla genetica vegetale : “Regulation of gene expression: from DNA to phenotype” tenutosi a Assisi nel 2009.

Tell me who your friends are and I'll tell what gene you are: coregulation analysis on microarray data from Arabidopsis

P. Morandini
Primo
2009

Abstract

La regolazione dei flussi metabolici non può essere discussa senza considerare la termodinamica delle reazioni enzimatiche implicate. Reazioni vicino all'equilibrio richiederanno enzimi con grandi Vmax, mentre reazioni lontane dall'equilibrio richiederanno Vmax poco superiori al flusso nella via. Questo significa che gli aumenti di flusso saranno mediati spesso da aumenti/attivazioni parallele di enzimi. Ne consegue che la coregolazione dei trascritti può essere un utile strumento per analizzare la funzione dei geni coinvlti nel metabolismo. Saranno discussi alcuni esempi paradigmatici e la validità generale dell'approccio.
11-giu-2009
Coregulation ; Arabidopsis ; transcription factor
Settore BIO/04 - Fisiologia Vegetale
Settore AGR/07 - Genetica Agraria
Società Italiana Genetica Agraria
Consorzio Interuniversitario Biotecnologie
http://www.agr.unipg.it/dbvba/sgmg/assisi09/Morandini.pdf
Tell me who your friends are and I'll tell what gene you are: coregulation analysis on microarray data from Arabidopsis / P. Morandini. ((Intervento presentato al 8. convegno Corso estivo di approfondimento sulla genetica vegetale : “Regulation of gene expression: from DNA to phenotype” tenutosi a Assisi nel 2009.
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