Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network
2021 M. Grapotte, M. Saraswat, C. Bessiere, C. Menichelli, J.A. Ramilowski, J. Severin, Y. Hayashizaki, M. Itoh, M. Tagami, M. Murata, M. Kojima-Ishiyama, S. Noma, S. Noguchi, T. Kasukawa, A. Hasegawa, H. Suzuki, H. Nishiyori-Sueki, M.C. Frith, I. Abugessaisa, S. Aitken, B.L. Aken, I. Alam, T. Alam, R. Alasiri, A.M.N. Alhendi, H. Alinejad-Rokny, M.J. Alvarez, R. Andersson, T. Arakawa, M. Araki, T. Arbel, J. Archer, A.L. Archibald, E. Arner, P. Arner, K. Asai, H. Ashoor, G. Astrom, M. Babina, J.K. Baillie, V.B. Bajic, A. Bajpai, S. Baker, R.M. Baldarelli, A. Balic, M. Bansal, A.O. Batagov, S. Batzoglou, A.G. Beckhouse, A.P. Beltrami, C.A. Beltrami, N. Bertin, S. Bhattacharya, P.J. Bickel, J.A. Blake, M. Blanchette, B. Bodega, A. Bonetti, H. Bono, J. Bornholdt, M. Bttcher, S. Bougouffa, M. Boyd, J. Breda, F. Brombacher, J.B. Brown, C.J. Bult, A.M. Burroughs, D.W. Burt, A. Busch, G. Caglio, A. Califano, C.J. Cameron, C.V. Cannistraci, A. Carbone, A.J. Carlisle, P. Carninci, K.W. Carter, D. Cesselli, J.-. Chang, J.C. Chen, Y. Chen, M. Chierici, J. Christodoulou, Y. Ciani, E.L. Clark, M. Coskun, M. Dalby, E. Dalla, C.O. Daub, C.A. Davis, M.J.L. de Hoon, D. de Rie, E. Denisenko, B. Deplancke, M. Detmar, R. Deviatiiarov, D. Di Bernardo, A.D. Diehl, L.C. Dieterich, E. Dimont, S. Djebali, T. Dohi, J. Dostie, F. Drablos, A.S.B. Edge, M. Edinger, A. Ehrlund, K. Ekwall, A. Elofsson, M. Endoh, H. Enomoto, S. Enomoto, M. Faghihi, M. Fagiolini, M.C. Farach-Carson, G.J. Faulkner, A. Favorov, A.M. Fernandes, C. Ferrai, A.R.R. Forrest, L.M. Forrester, M. Forsberg, A. Fort, M. Francescatto, T.C. Freeman, M. Frith, S. Fukuda, M. Funayama, C. Furlanello, M. Furuno, C. Furusawa, H. Gao, I. Gazova, C. Gebhard, F. Geier, T.B.H. Geijtenbeek, S. Ghosh, Y. Ghosheh, T.R. Gingeras, T. Gojobori, T. Goldberg, D. Goldowitz, J. Gough, D. Greco, A.J. Gruber, S. Guhl, R. Guigo, R. Guler, O. Gusev, S. Gustincich, T.J. Ha, V. Haberle, P. Hale, B.M. Hallstrom, M. Hamada, L. Handoko, M. Hara, M. Harbers, J. Harrow, J. Harshbarger, T. Hase, A. Hasegawa, K. Hashimoto, T. Hatano, N. Hattori, R. Hayashi, Y. Hayashizaki, M. Herlyn, K. Hettne, P. Heutink, W. Hide, K.J. Hitchens, S.H. Sui, P.A.C. 't Hoen, C.C. Hon, F. Hori, M. Horie, K. Horimoto, P. Horton, R. Hou, E. Huang, Y. Huang, R. Hugues, D. Hume, H. Ienasescu, K. Iida, T. Ikawa, T. Ikemura, K. Ikeo, N. Inoue, Y. Ishizu, Y. Ito, M. Itoh, A.V. Ivshina, B.R. Jankovic, P. Jenjaroenpun, R. Johnson, M. Jorgensen, H. Jorjani, A. Joshi, G. Jurman, B. Kaczkowski, C. Kai, K. Kaida, K. Kajiyama, R. Kaliyaperumal, E. Kaminuma, T. Kanaya, H. Kaneda, P. Kapranov, A.S. Kasianov, T. Kasukawa, T. Katayama, S. Kato, S. Kawaguchi, J. Kawai, H. Kawaji, H. Kawamoto, Y.I. Kawamura, S. Kawasaki, T. Kawashima, J.S. Kempfle, T.J. Kenna, J. Kere, L. Khachigian, H. Kiryu, M. Kishima, H. Kitajima, T. Kitamura, H. Kitano, E. Klaric, K. Klepper, S.P. Klinken, E. Kloppmann, A.J. Knox, Y. Kodama, Y. Kogo, M. Kojima, S. Kojima, N. Komatsu, H. Komiyama, T. Kono, H. Koseki, S. Koyasu, A. Kratz, A. Kukalev, I. Kulakovskiy, A. Kundaje, H. Kunikata, R. Kuo, T. Kuo, S. Kuraku, V.A. Kuznetsov, T.J. Kwon, M. Larouche, T. Lassmann, A. Law, K.-. Le-Cao, C.-. Lecellier, W. Lee, B. Lenhard, A. Lennartsson, K. Li, R. Li, B. Lilje, L. Lipovich, M. Lizio, G. Lopez, S. Magi, G.K. Mak, V. Makeev, R. Manabe, M. Mandai, J. Mar, K. Maruyama, T. Maruyama, E. Mason, A. Mathelier, H. Matsuda, Y.A. Medvedeva, T.F. Meehan, N. Mejhert, A. Meynert, N. Mikami, A. Minoda, H. Miura, Y. Miyagi, A. Miyawaki, Y. Mizuno, H. Morikawa, M. Morimoto, M. Morioka, S. Morishita, K. Moro, E. Motakis, H. Motohashi, A.K. Mukarram, C.L. Mummery, C.J. Mungall, Y. Murakawa, M. Muramatsu, M. Murata, K. Nagasaka, T. Nagase, Y. Nakachi, F. Nakahara, K. Nakai, K. Nakamura, Y. Nakamura, Y. Nakamura, T. Nakazawa, G.P. Nason, C. Nepal, Q.H. Nguyen, L.K. Nielsen, K. Nishida, K.M. Nishiguchi, H. Nishiyori, K. Nitta, S. Noguchi, S. Noma, C. Notredame, S. Ogishima, N. Ohkura, H. Ohno, M. Ohshima, T. Ohtsu, Y. Okada, M. Okada-Hatakeyama, Y. Okazaki, P. Oksvold, V. Orlando, G.S. Ow, M. Ozturk, M. Pachkov, T. Paparountas, S.P. Parihar, S.-. Park, G. Pascarella, R. Passier, H. Persson, I.H. Philippens, S. Piazza, C. Plessy, A. Pombo, F. Ponten, S. Poulain, T.M. Poulsen, S. Pradhan, C. Prezioso, C. Pridans, X.-. Qin, J. Quackenbush, O. Rackham, J. Ramilowski, T. Ravasi, M. Rehli, S. Rennie, T. Rito, P. Rizzu, C. Robert, M. Roos, B. Rost, F. Roudnicky, R. Roy, M.B. Rye, O. Sachenkova, P. Saetrom, H. Sai, S. Saiki, M. Saito, A. Saito, S. Sakaguchi, M. Sakai, S. Sakaue, A. Sakaue-Sawano, A. Sandelin, H. Sano, Y. Sasamoto, H. Sato, A. Saxena, H. Saya, A. Schafferhans, S. Schmeier, C. Schmidl, D. Schmocker, C. Schneider, M. Schueler, E.A. Schultes, G. Schulze-Tanzil, C.A. Semple, S. Seno, W. Seo, J. Sese, J. Severin, G. Sheng, J. Shi, Y. Shimoni, J.W. Shin, J. Simonsanchez, A. Sivertsson, E. Sjostedt, C. Soderhall, G.S. Laurent, M.H. Stoiber, D. Sugiyama, K.M. Summers, A.M. Suzuki, H. Suzuki, K. Suzuki, M. Suzuki, N. Suzuki, T. Suzuki, D.J. Swanson, R.K. Swoboda, M. Tagami, A. Taguchi, H. Takahashi, M. Takahashi, K. Takamochi, S. Takeda, Y. Takenaka, K.T. Tam, H. Tanaka, R. Tanaka, Y. Tanaka, D. Tang, I. Taniuchi, A. Tanzer, H. Tarui, M.S. Taylor, A. Terada, Y. Terao, A.C. Testa, M. Thomas, S. Thongjuea, K. Tomii, E.T. Triglia, H. Toyoda, H.G. Tsang, M. Tsujikawa, M. Uhlen, E. Valen, M. van de Wetering, E. van Nimwegen, D. Velmeshev, R. Verardo, M. Vitezic, K. Vitting-Seerup, K. von Feilitzen, C.R. Voolstra, I.E. Vorontsov, C. Wahlestedt, W.W. Wasserman, K. Watanabe, S. Watanabe, C.A. Wells, L.N. Winteringham, E. Wolvetang, H. Yabukami, K. Yagi, T. Yamada, Y. Yamaguchi, M. Yamamoto, Y. Yamamoto, Y. Yamamoto, Y. Yamanaka, K. Yano, K. Yasuzawa, Y. Yatsuka, M. Yo, S. Yokokura, M. Yoneda, E. Yoshida, Y. Yoshida, M. Yoshihara, R. Young, R.S. Young, N.Y. Yu, N. Yumoto, S.E. Zabierowski, P.G. Zhang, S. Zucchelli, M. Zwahlen, C. Chatelain, P. Carninci, M.J.L. de Hoon, W.W. Wasserman, L. Brehelin, C.-. Lecellier